Analisa Evolusi Virus Dengue Yang Endemik Di Indonesia

Erick Sidarta1, Dokumen and Sari Mariyati Dewi2, Dokumen and Arlends Chris3, Dokumen (2019) Analisa Evolusi Virus Dengue Yang Endemik Di Indonesia. Analisa Evolusi Virus Dengue Yang Endemik Di Indonesia, 3 (1). pp. 91-98. ISSN ISSN 2579-6402 (Versi Cetak) ISSN-L 2579-6410 (Versi Elektronik)

Text ERICK S FK DOKUMEN BIDANG B.pdf Download (1MB)

Abstract

ABSTRAK
Indonesia merupakan daerah dengan hiperendemisitas tinggi untuk infeksi virus dengue dan tempat bersirkulasinya
keempat varian genotype virus dengue. Saat ini salah satu cara untuk pencegahan infeksi virus dengue adalah
dengan vaksin dengue yang baru tersedia tahun 2016. Vaksin dengue ini menstimulasi terbentuknya antibodi yang
akan mengenali membran dan selubung dari keempat genotipe virus dengue. Efektivitas dari vaksin ini tergantung
dari kesesuaian antara antibodi yang terbentuk dengan varian yang beredar di Indonesia. Mengingat virus dengue
merupakan virus RNA yang umumnya memiliki laju mutasi yang tinggi, mutasi yang terjadi dapat mengakibatkan
terbentuknya escape mutant yang mampu menghindari antibodi yang terbentuk oleh vaksin. Penelitian ini bertujuan
untuk mengetahui evolusi dan laju mutasi dari virus dengue yang beredar di Indonesia. Sebanyak 116 data genom
lengkap dari virus dengue yang telah dilaporkan di Indonesia digunakan dalam penelitian ini. Genotipe virus dengue
dianalisa dengan menggunakan software MEGA-X. Evolusi dan laju mutasi dari gen penyandi selubung (E) dan
membran (M) virus dengue dianalisa dengan menggunakan software BEAST versi 1.8.3. Hasil dari penelitian ini
menunjukkan gen E dan M virus dengue telah berevolusi semenjak pertama kali dilaporkan pada tahun 1975 dan
memiliki laju mutasi yang tinggi. Gen E mencapai 9.26 x 10-4 subsitusi/basa/tahun (95% HPD 7.81 X 10 10-4
– 1.07
X 10-3
) maupun gen M yang mencapai 8.5 x 10-4 subsitusi/basa/tahun (95% HPD 6.03 X 10 10-4
– 1.09 X 10-3
).
Tingginya laju mutasi ini membutuhkan perhatian bagi pengembang vaksin untuk pengawasan dan evaluasi yang
berkesinambungan.
Kata Kunci: dengue; evolusi; laju mutasi; selubung; membran
ABSTRACT
Indonesia is an area with high hyperendemicity for dengue virus infection and the circulation of the four variants of
dengue virus genotype. Currently, one way to prevent dengue virus infection is with a new dengue vaccine available
in 2016. This dengue vaccine stimulates the formation of antibodies that will recognize the membrane and envelope
of the four dengue virus genotypes. The effectiveness of this vaccine depends on the suitability of the antibodies
formed with variants circulating in Indonesia. Since dengue virus is an RNA virus that generally has a high
mutation rate, the mutations that occur can result in the formation of escape mutants that are able to avoid the
antibodies formed by the vaccine. This study aims to determine the evolution and mutation rate of dengue viruses
circulating in Indonesia. A total of 116 complete genome data from dengue viruses that have been reported in
Indonesia were used in this study. Dengue virus genotypes were analyzed using MEGA-X software. The evolution
and mutation rate of the envelope (E) and membrane (M) gene of the dengue virus were analyzed using BEAST
software version 1.8.3. The results of this study indicate that the E and M genes of the dengue virus have evolved
since they were first reported in 1975 and have a high mutation rate. Gen E reaches 9.26 x 10-4 substitution / base /
year (95% HPD 7.81 X 10 10-4 - 1.07 X 10-3) and M gene reaches 8.5 x 10-4 substitution / base / year (95% HPD
6.03 X 10 10-4 - 1.09 X 10-3). The high rate of this mutation requires attention for vaccine developers for ongoing
monitoring and evaluation.
Keywords: dengue; evolution; mutation rate; sheath; membrane

https://doi.org/10.24912/jmstkik.v3i1.2856 91

Item Type:	Article
Subjects:	Jurnal
Divisions:	Fakultas Kedokteran > Kedokteran
Depositing User:	REKTORAT UNTAR
Date Deposited:	15 Mar 2022 04:42
Last Modified:	15 Mar 2022 04:42
URI:	https://repotest.untar.ac.id/id/eprint/34281

Actions (login required)

View Item